Założone 1946 pod nazwą Muzeum Aptekarstwa Ziemi Krakowskiej. Od 1952 nosiło nazwę Muzeum Historyczne Aptekarstwa Polskiego. Po przejęciu zbiorów przez Główną Bibliotekę Lekarską w Warszawie muzeum istniało pod nazwą Ośrodek Dokumentacji Farmaceutycznej GBL z siedzibą w Krakowie. 01.01.1961. zbiory włączono do Wydziału Farmaceutycznego Akademii Medycznej w Krakowie pod nazwą Muzeum Farmacji, od 1973 Akademii Medycznej im. Mikołaja Kopernika. W 1993 Akademia Medyczna im. Mikołaja Kopernika weszła w skład UJ jako Collegium Medicum, któremu podlega Muzeum Farmacji.

Muzeum Farmacji Uniwersytetu Jagiellońskiego / Leszek J. Ekiert [et al.]. - Kraków, 1996.

Muzeum Farmacji Akademii Medycznej w Krakowie / Wojciech Roeske. - Kraków, 1977.

http://www.uj.edu.pl/dispatch.jsp?item=uniwersytet/historia/muzeum_farmacji.jsp

http://www.odyssei.com/pl/travel-tips/17973.html

Rośliny lecznicze w ekslibrisie Krzysztofa Kmiecia. - Kraków, 1994. Na s. 2. (Wystawa exlibrisów: Muzeum Farmacji Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego)

Krzysztof Kmieć (1950-2011) : ekslibrisy farmaceutyczne oraz ekslibrisy in memoriam Krzysztofa Kmiecia 2014 : Kraków, 10-22 marca 2014 r. / [oprac. i red. kat. Iwona Dymarczyk, Andrzej Znamirowski]. - Kraków, 2014. S. tyt. (Muzeum Farmacji UJ CM w Krakowie)